Titel der Ausschreibung

2 Softwarelizenzen für Proteome Discoverer 3.0

CPV-Code / Auftragsgegenstand

4
Abbau von Gerüsten

Abgabefrist

n.V.

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Vergabeart / Vergabeordnung

National UVGO

Mandant

Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie e. V. - Hans-Knöll-Institut

Ort der Ausführung

Adolf-Reichwein-Str. 23, 07745 Jena

Art und Umfang der Leistung

Die Anforderungen an eine Software zur Identifizierung und Quantifizierung von Proteinen steigen rasant. Daher ist eine neue Software für unsere Orbitrap-Massenspektrometer, die dem jetzigen Stand der Technik entspricht, notwendig, um die komplexen massenspektrometrischen Daten auswerten zu können. Mit der Anschaffung unseres neuen Massenspektrometers Orbitrap Exploris 480 mit FAIMS (High Field Asymmetric Waveform Ion Mobility Spectrometry) hat die Software zudem das Alleinstellungsmerkmal, mit Rohdaten dieser speziellen Spielart der Ionenmobilitäts-Massenspektrometrie umgehen zu können. Eine weitere Begründung für den Kauf ist die Implementierung eines völlig neuen Suchalgorithmus ("Chimerys"), der die Identifikationsrate von Proteinen signifikant erhöht (30-40%). Der Algorithmus basiert auf einem Deep-Learning Ansatz, der MS/MS-Chimärenspektren co-isolierter Peptide auf der Grundlage genauer Vorhersagen von Peptidfragment-Ionenintensitäten und Retentionszeiten voraussagen und mit experimentellen Spektren abgleichen kann. Die Notwendigkeit des Erwerbs von 2 Lizenzen, ist dem hohen Probenaufkommen und der Anzahl unserer Analyse-Geräte (3) geschuldet, die rund um die Uhr komplexe Daten generieren, die der Auswertung bedürfen.

CPV-Code / Auftragsgegenstand

4
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Status

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